Desde a sua criação em 2002, o programa PDBEB e os seus estudantes têm recebido apoio financeiro da FCT- Fundação para a Ciência e Tecnologia, ações Marie Curie, programas Erasmus, Fundação Luso-Americana para o Desenvolvimento, Comissão Fullbright, Sociedade Europeia de Investigação Clínica, FEBS, Sociedade Portuguesa de Bioquímica, Bluepharma, bem como outras entidades públicas e privadas.